Наталья Бурдина пришла в «Протек» в 2003 году, где до 2012 года развивала направление работы с производителями парафарм-ассортимента. В 2012 году перешла в розничное подразделение – «Риглу».

В 2015–2019 годах занимала должность директора по маркетингу, с 2019 по 2024 год – коммерческого директора аптечной сети. На этих постах она отвечала за взаимодействие с фармпроизводителями, разработку и продвижение собственных торговых марок, маркетинг и рекламу, логистику прямых поставок.

Неоднократно входила в рейтинг «ТОП1000 российских менеджеров», ежегодно составляемый Ассоциацией менеджеров России. Так, по итогам 2023 года Наталья Бурдина возглавила рейтинг коммерческих директоров из отрасли «торговля».

В июне 2024 года Наталья Бурдина покинула «Риглу» вместе с гендиректором фармритейлера Александром Филипповым для работы во вновь созданном структурном подразделении – Торговом доме «Протек». Подразделение должно было замкнуть на себе всю коммерческую политику группы компаний.