Согласно проекту порядка, ассигнования будут направляться в виде субсидий на иные цели на основании соглашения, заключенного терфондом с медорганизацией. Условием предоставления средств будет являться направление клиникой ежемесячной заявки в ТФОМС (в течение пяти рабочих дней текущего месяца).

Размер субсидии будет рассчитываться по специальной формуле, учитывающей объем средств для осуществления расходов (на заработную плату, коммунальные и прочие расходы) и количество отдельных медорганизаций. Средства будут поступать в клиники в течение трех рабочих дней после того, как иной трансферт поступит из бюджета ФФОМС в терфонд.

Медучреждение должно предоставлять отчет в ТФОМС об использовании субсидии. Средства, использованные не по целевому назначению, будут подлежать возврату в бюджет терфонда. Неиспользованный в отчетном финансовом году остаток субсидии по состоянию на 1 января очередного финансового года не будет подлежать возврату в бюджет терфонда, он будет направляться на осуществление аналогичных расходов в последующие периоды.

В качестве приложений проект приказа также содержит образцы соглашения о предоставлении субсидии, заявки и отчета.

О том, что медорганизации новых регионов, включенные в базовую программу ОМС, будут получать субсидии из бюджета ФФОМС, стало известно в декабре 2025 года, после того как президент РФ Владимир Путин утвердил масштабные корректировки в № 326-ФЗ «Об ОМС».

С момента включения ДНР, ЛНР, Запорожской и Херсонской областей в контур российской нормативно-правовой базы подобный порядок устанавливался Минздравом ежегодно. С 2024 года медпомощь в новых регионах оплачивается частично из федерального бюджета, частично – прямыми межбюджетными трансфертами из бюджета ФФОМС. Так, в 2024 году бюджет ОМС этих регионов составил 39 млрд рублей, а в 2025 году он вырос до 58,1 млрд рублей.