Рогожников был назначен на должность замглавы ФМБА в 2004 году. До этого он работал заместителем главного врача Читинской областной клинической больницы, руководил Управлением здравоохранения администрации Читинской области, заведовал Научно-методическим центром региональной политики в области здравоохранения Центрального НИИ организации и информатизации Минздрава РФ, а в январе 2001 года возглавил ведомственный Департамент организации медицинской помощи и профилактики неинфекционных заболеваний.

После назначения в ФМБА занимался координаций медицинского обеспечения космических полетов, включая отбор, медицинское освидетельствование космонавтов и контроль за состоянием их здоровья, руководил организацией медицинского обеспечения водолазных работ и координировал медобеспечения работ по уничтожению химического оружия. Кроме того, он курировал исследования в области космической медицины.

В начале апреля 2021 года со своего поста ушла другой заместитель руководителя ФМБА – Юлия Мирошникова, занимавшая должность с 2017 года.

Таким образом, по состоянию на май 2021 года у главы ФМБА Вероники Скворцовой осталось пять заместителей – первый заместитель Татьяна Яковлева и заместители Наталья Стадченко, Андрей Дыдыкин, Наталья Михайлова и Игорь Борисевич. Первые трое, как и Вероника Скворцова, перешли на работу в ФМБА течение 2020 года из других структур, а Игорь Борисевич был назначен замруководителя ФМБА в сентябре 2020 года.