Юлия Мирошникова в 1997 году окончила Уральскую государственную медицинскую академию по специальности «лечебное дело», в 1998 году – интернатуру по специальности «дерматовенерология». С 2003 по 2005 год проходила обучение по программе MBA при Урало-Сибирском институте бизнеса. В 2014 году окончила Российскую академию народного хозяйства и государственной службы при Президенте РФ по специальности «государственное и муниципальное управление».

В ФМБА Мирошникова работала с 2009 года. В течение года она была заместителем начальника отдела спортивной фармакологии Управления спортивной медицины. С 2010 по 2017 год занимала должность начальника этого управления. Правительственным распоряжением №705-р от 14 апреля 2017 года Юлия Мирошникова была назначена заместителем руководителя ФМБА.

Мирошникова также является секретарем рабочей группы по развитию спортивной медицины Совета при Президенте РФ по развитию физической культуры и спорта, членом штаба по контролю за обеспечением подготовки спортивных сборных команд для участия в Олимпийских и Паралимпийских играх при Минспорта, членом организационного комитета по подготовке российских спортсменов к Олимпийским играм и Паралимпийским играм при правительстве.

Сейчас у руководителя ФМБА Вероники Скворцовой осталось шесть заместителей: первый заместитель Татьяна Яковлева, Вячеслав Рогожников, Наталья Стадченко, Андрей Дыдыкин, Наталья Михайлова и Игорь Борисевич. Седьмым заместителем была Юлия Мирошникова.

Дыдыкин, Стадченко и Яковлева, как и Вероника Скворцова, перешли на работу в ФМБА течение 2020 года из других структур. Игорь Борисевич был назначен замруководителя ФМБА в сентябре 2020 года.